Jednotlivé typy systémov sa rozdeľujú najmä podľa spôsobu hydroponického pestovania rastlín, ktoré môžeme deliť do niekoľkých kategórií.
Pestovanie v periodicky zaplavovaných nádržiach so substrátom
Ide o najčastejšie používaný typ pestovania v malých akvaponických systémoch. Anglicky Flood and Drain. Nádrž je vybavená spravidla „sifónom“, ktorý po napustení automaticky vypustí vodu z rastového poľa ďalej do systému. Takto periodicky zaplavovaný substrát (keramzit, štrk) poskytuje koreňom rastlín ideálne prostredie bohaté ako na živiny, tak aj na kyslík. Tieto rastové polia so substrátom sa tiež často umiestňujú pred rastové polia s raftami, prípadne NFT, ako filtre pevných častíc a biofilter, v ktorom prebieha nitrifikácia.

Raftový systém
Rafty predstavujú najčastejšie polystyrénové dosky s otvormi pre košíky, alebo minerálnu vatu so sadenicami rastlín. Rastliny takto plávajú na hladine nádrže – rastového poľa, ktorý má podobu plytkého bazéna. Korene rastlín tak voľne plávajú vo vode. Pre dostatočné okysličenie koreňov a prísun živín k nim je potrebné neustále prúdenie vody, prípadne aj umiestnenie vzduchovacích kameňov. Výhodou tohto systému je veľmi jednoduchá manipulácia, ako s jednotlivými polystyrénovými doskami, tak aj s rastlinami, ktoré sa takto pohodlne zberajú.

NFT systém
Skratka NFT znamená Nutriet Film Technique. Tento spôsob pestovania sa často využíva v hydropónii a jedná sa o sústavu potrubí s otvormi pre jednotlivé rastliny. Sústavou preteká voda s veľmi nízkou hladinou. Korene rastlín z tohto vodného filmu získavajú živiny a z okolitého vzduchu kyslík. Veľmi obľúbenou, a často propagovanou modifikáciou NFT, sú vertikálne veže, ktoré sú významné najmä v tom, že dokážu maximalizovať využitie pestovateľskej plochy, a teda dovoľuje pestovať veľké množstvo rastlín na malej ploche. Voda vďaka gravitácií preteká vežou a dodáva živiny rastlinám zasadeným do špeciálnej penovej hmoty. Tento spôsob pestovania propaguje a predáva ako Zip Grow Towers doktor Nate Storey z Bright Agrotech. Metóda vyžaduje veľmi dobrú filtráciu pevnej časti kalu, ktorý by mohol upchávať rozvody vody a samotné vertikálne veže.

Aeroponické pestovanie
Je ultimatívna metóda hydroponického pestovania rastlín, ktoré je možné využiť aj v akvapónii. Korene rastlín sú oprašované kvapôčkami živného roztoku zo špeciálnych trysiek. Metóda maximalizuje prístup kyslíka ku koreňom rastlín, ktoré vďaka tomu oveľa lepšie vstrebávajú živiny z vody a využívajú ich pre svoj rast. Takýto systém je ale technicky náročný a vyžaduje veľmi dobrý filtračný systém, ktorý zbaví vodu všetkého pevného odpadu.
Zdroj: https://fishpoop.info/